Вообще, за согласования денег брать не должны. Сколько лет согласовываю всякого рода проектную дкументацию, с оплатой за согласование не сталкивался (ну, если только в "неформальном" виде). Вы представьте - это ж кормушка бездонная получится, ведь в оформлении проектной документации можно придраться к сотне-другой формальных причин.
Но ведь фобос коммерческая организация ? Например те же РОСС и ОЖИКОМ согласовывают перепланировки за деньги , причем вполне официально.